कम-कार्ब आहार के दीर्घकालिक प्रभावों के संबंध में विवाद वैज्ञानिक समुदाय में कम नहीं हुए हैं। यदि हम कम समय में तेजी से वजन घटाने को ध्यान में रखते हैं, तो ऐसे आहार काफी प्रभावी हैं। लेकिन कुछ वैज्ञानिकों को इस तरह के आहार के पोषण मूल्य के बारे में संदेह है। विशेषज्ञों को यह कहना भी मुश्किल है कि आहार की ऐसी संरचना के क्या परिणाम हो सकते हैं।
जॉन बकले, दक्षिण ऑस्ट्रेलिया विश्वविद्यालय में स्वास्थ्य के एक प्रोफेसर, आश्वस्त हैं कि किसी विशेष आहार पर सलाह देने से पहले, आपको इस तरह के विकल्प के निहितार्थ को समझने की आवश्यकता है। लो-कार्ब डाइट के बारे में वह कहते हैं: कार्बोहाइड्रेट का सेवन कम करने से "खराब कोलेस्ट्रॉल" का स्तर बढ़ सकता है। इसलिए हृदय संबंधी समस्याएं।
यह माना जाना चाहिए कि "खराब कोलेस्ट्रॉल" का स्तर, सौभाग्य से, थोड़ी देर के बाद कम हो जाता है। लेकिन खोया हुआ वजन हासिल किए गए स्तर पर नहीं रहता है। एक नियम के रूप में, किलोग्राम प्राप्त होते हैं और काफी जल्दी होते हैं।
जो बहुत अधिक गंभीर है वह मूड से संबंधित लंबे समय तक चलने वाली समस्याओं की संभावना है, जैसे कि अवसाद। इसके अलावा, कार्बोहाइड्रेट (और उनके स्रोत पूरे अनाज, सब्जियों और फलों के रूप में इस तरह के उपयोगी पौधे खाद्य पदार्थ) से इनकार करते हैं, एक व्यक्ति आवश्यक पोषक तत्वों और एंटीऑक्सिडेंट खो देता है जो हृदय और रक्त वाहिकाओं पर लाभकारी प्रभाव डालते हैं। फाइबर, कैल्शियम, और फोलिक एसिड भी सही मात्रा में उपलब्ध नहीं हैं।